選擇第三方海外倉的成本都較高。在貨物量大的情況下，使用亞馬遜FBA倉的成本相對更高，但賣家可以提高產品單價來分攤倉儲成本。選擇第三方海外倉的話，賣家可以通過降低產品價格來吸引客戶。

亞馬遜FBA倉可以增加賣家產品的曝光度，提高Listing排名，幫助賣家搶奪購物車等，這些都有利于提高賣家店鋪的流量與銷量。而第三方海外倉服務商無法提供類似的支持，賣家需要自己進行站內外的推廣。

由FBA導致的中差評都可以由亞馬遜移除，賣家無需操心；而由第三方海外倉引起的中差評，服務商可能無法提供售后與投訴服務，即使提供了，也可能無法成功消除中差評。一般第三方海外倉很少有因物流派送而引起的差評。

亞馬遜支持客戶無條件退換貨，但退回的產品會被銷毀或寄還賣家，亞馬遜會另收取費用。第三方海外倉可以替賣家更換標簽或重新包裝后再次銷售，減少損失。

將貨物放在海外倉都存在潛在的安全風險。將貨物存放在第三方海外倉中不用擔心安全問題，而將貨物放在亞馬遜FBA倉中則可能因賬號安全問題導致貨物被查封。

無論選擇亞馬遜FBA倉還是第三方海外倉，都有各自的長處與短處。賣家可以根據自身的實際情況選擇合適的物流方式。這些差異比較和風險分析對于做出明智的決策非常重要。